mason/locus/locus_genomic_annotations.mas

   1 <%args>
   2     $locus
   3 </%args>
   4
   5
   6 % if( @gbrowse_match_xrefs ) {
   7
   8   <& /sitefeatures/gbrowse2/xref_set/rich.mas,
   9       xrefs => \@gbrowse_match_xrefs
  10    &>
  11
  12 % }
  13
  14 <%init>
  15    # look up any gbrowse cross-refs for this locus id, if any
  16    my @gbrowse = $c->enabled_feature('gbrowse2');
  17    my @gbrowse_match_xrefs = map {
  18        $_->xrefs({
  19            -types      => ['match'],
  20            -attributes => { sgn_locus_id => $locus->get_locus_id },
  21        })
  22    } @gbrowse;
  23 </%init>