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   1 <& /page/page_title.mas, title => 'About Secretory Pathways' &>
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   3 <div class="indented_content" style="width: 80%; margin: 1em auto">
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   6      The primary route for protein secretion from eukaryotic cells is
   7      termed the classical, or endoplasmic reticulum
   8      (ER)/Golgi-dependent, secretory pathway. Briefly, secreted
   9      eukaryotic proteins utilize an N-terminal signal peptide (SP) to
  10      direct their co-translation on ER-bound ribosomes into the ER
  11      lumen, after which they progress through the endomembrane system
  12      and are ultimately exported to the extracellular environment, or
  13      cell surface. It should be noted that these represent a subset of
  14      SP-containing proteins, since others are retained in the ER or
  15      Golgi or are redirected to other compartments, such as the vacuole.
  16   </p>
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  18   <div style="width: 500px" class="captioned_image">
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  20     <img src="/documents/img/secretom/classical_secretory_pathway_400.png" />
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  23     <p>
  24       Schematic diagram of the plant classical secretory pathway,
  25       highlighting protein co-translational translocation from ER-bound
  26       ribosomes in the ER lumen and the subsequent major trafficking
  27       pathways (N, nucleus; ER, endoplasmic reticulum, Chl, chloroplast;
  28       TGN, trans-Golgi network; PVC pre-vacuolar compartment; PM, plasma
  29       membrane; CW, cell wall). Adapted from
  30       <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18627574">Foresti and
  31       Denecke (2008)</a>.
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  33     </p>
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  35   </div>
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  38   <p>
  39      There is also growing evidence that plant proteins can be secreted
  40      to the apoplast via routes that are independent of the ER-Golgi
  41      pathway. Such proteins do not have canonical signal peptides and
  42      treatment with chemical inhibitors, such as brefeldin A, which
  43      disrupt vesicle trafficking between the ER and Golgi, and does not
  44      perturb secretion. While such non-classical pathways have been
  45      studied in <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16356720">yeast</a>
  46      and <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19122676">mammalian
  47      cells</a>, and a <a href="http://www.cbs.dtu.dk/services/SecretomeP/">
  48      search tool</a> is available for such mammalian proteins,
  49      essentially nothing is yet known about such pathways in
  50      plants. This will be addressed in this project.
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