ontology/cxgn_statistics.obo

   1 format-version: 1.2
   2 ontology: SGNStatistics_ontology
   3 default-namespace: SGNStatistics_ontology
   4
   5 [Term]
   6 id: SGNSTAT:0000000
   7 name: SGNSTAT
   8
   9 [Term]
  10 id: SGNSTAT:0000001
  11 name: Multivariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and row and column spatial effects computed using Sommer R
  12 is_a: SGNSTAT:0000000
  13
  14 [Term]
  15 id: SGNSTAT:0000002
  16 name: Univariate linear mixed model genetic BLUPs using germplasmName computed using LMER R
  17 is_a: SGNSTAT:0000000
  18
  19 [Term]
  20 id: SGNSTAT:0000003
  21 name: Multivariate linear mixed model 2D spline spatial BLUPs using genetic relationship matrix and row and column spatial effects computed using Sommer R
  22 is_a: SGNSTAT:0000000
  23
  24 [Term]
  25 id: SGNSTAT:0000004
  26 name: Multivariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using Sommer R
  27 is_a: SGNSTAT:0000000
  28
  29 [Term]
  30 id: SGNSTAT:0000005
  31 name: Multivariate linear mixed model permanent environment BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using Sommer R
  32 is_a: SGNSTAT:0000000
  33
  34 [Term]
  35 id: SGNSTAT:0000006
  36 name: Multivariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using Sommer R
  37 is_a: SGNSTAT:0000000
  38
  39 [Term]
  40 id: SGNSTAT:0000007
  41 name: Multivariate linear mixed model permanent environment BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using Sommer R
  42 is_a: SGNSTAT:0000000
  43
  44 [Term]
  45 id: SGNSTAT:0000008
  46 name: Multivariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using BLUPf90
  47 is_a: SGNSTAT:0000000
  48
  49 [Term]
  50 id: SGNSTAT:0000009
  51 name: Multivariate linear mixed model permanent environment BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using BLUPf90
  52 is_a: SGNSTAT:0000000
  53
  54 [Term]
  55 id: SGNSTAT:0000010
  56 name: Multivariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using BLUPf90
  57 is_a: SGNSTAT:0000000
  58
  59 [Term]
  60 id: SGNSTAT:0000011
  61 name: Multivariate linear mixed model permanent environment BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using BLUPf90
  62 is_a: SGNSTAT:0000000
  63
  64 [Term]
  65 id: SGNSTAT:0000012
  66 name: Univariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and separable Ar1xAr1 row and column effect computed using ASReml
  67 is_a: SGNSTAT:0000000
  68
  69 [Term]
  70 id: SGNSTAT:0000013
  71 name: Univariate linear mixed model spatial BLUPs using genetic relationship matrix and separable Ar1xAr1 row and column effect computed using ASReml
  72 is_a: SGNSTAT:0000000
  73
  74 [Term]
  75 id: SGNSTAT:0000014
  76 name: Partial least squares regression (PLSR) as implemented with the pls package in R
  77 is_a: SGNSTAT:0000000
  78
  79 [Term]
  80 id: SGNSTAT:0000015
  81 name: Random Forest (RF) regression as implemented with the RandomForest package in R
  82 is_a: SGNSTAT:0000000
  83
  84 [Term]
  85 id: SGNSTAT:0000016
  86 name: Support vector machine (SVM) regression with linear kernel as implemented with the kernLab package in R
  87 is_a: SGNSTAT:0000000
  88
  89 [Term]
  90 id: SGNSTAT:0000017
  91 name: Support vector machine (SVM) regression with radial kernel as implemented with the kernLab package in R
  92 is_a: SGNSTAT:0000000
  93
  94 [Term]
  95 id: SGNSTAT:0000018
  96 name: Multivariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using AIREMLf90
  97 is_a: SGNSTAT:0000000
  98
  99 [Term]
 100 id: SGNSTAT:0000019
 101 name: Multivariate linear mixed model permanent environment BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using AIREMLf90
 102 is_a: SGNSTAT:0000000
 103
 104 [Term]
 105 id: SGNSTAT:0000020
 106 name: Multivariate linear mixed model genetic BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using AIREMLf90
 107 is_a: SGNSTAT:0000000
 108
 109 [Term]
 110 id: SGNSTAT:0000021
 111 name: Multivariate linear mixed model permanent environment BLUPs using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using AIREMLf90
 112 is_a: SGNSTAT:0000000
 113
 114 [Term]
 115 id: SGNSTAT:0000022
 116 name: Two-dimension numerical first derivative across rows and columns
 117 is_a: SGNSTAT:0000000
 118
 119 [Term]
 120 id: SGNSTAT:0000023
 121 name: Two-dimension numerical second derivative across rows and columns
 122 is_a: SGNSTAT:0000000
 123
 124 [Term]
 125 id: SGNSTAT:0000024
 126 name: Multivariate genetic BLUPs using genetic relationship matrix computed using Sommer R
 127 is_a: SGNSTAT:0000000
 128
 129 [Term]
 130 id: SGNSTAT:0000025
 131 name: Adjusted means using LMER R
 132 is_a: SGNSTAT:0000000
 133
 134 [Term]
 135 id: SGNSTAT:0000026
 136 name: Multivariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using AIREMLf90
 137 is_a: SGNSTAT:0000000
 138
 139 [Term]
 140 id: SGNSTAT:0000027
 141 name: Multivariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using AIREMLf90
 142 is_a: SGNSTAT:0000000
 143
 144 [Term]
 145 id: SGNSTAT:0000028
 146 name: Multivariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using BLUPf90
 147 is_a: SGNSTAT:0000000
 148
 149 [Term]
 150 id: SGNSTAT:0000029
 151 name: Multivariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using BLUPf90
 152 is_a: SGNSTAT:0000000
 153
 154 [Term]
 155 id: SGNSTAT:0000030
 156 name: Multivariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on days after planting computed using Sommer R
 157 is_a: SGNSTAT:0000000
 158
 159 [Term]
 160 id: SGNSTAT:0000031
 161 name: Multivariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and temporal Legendre polynomial random regression on growing degree days computed using Sommer R
 162 is_a: SGNSTAT:0000000
 163
 164 [Term]
 165 id: SGNSTAT:0000032
 166 name: Multivariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and 2D spline row and column spatial effects computed using Sommer R
 167 is_a: SGNSTAT:0000000
 168
 169 [Term]
 170 id: SGNSTAT:0000033
 171 name: Univariate linear mixed model residual using genetic relationship matrix and separable Ar1xAr1 row and column effect computed using ASReml
 172 is_a: SGNSTAT:0000000
 173
 174 [Term]
 175 id: SGNSTAT:0000034
 176 name: Adjusted means from BLUPs using LMER R
 177 is_a: SGNSTAT:0000000
 178
 179 [Term]
 180 id: SGNSTAT:0000035
 181 name: Phenotypic BLUPs using LMER R
 182 is_a: SGNSTAT:0000000
 183
 184 [Term]
 185 id: SGNSTAT:0000036
 186 name: Adjusted means from BLUEs using LMER R
 187 is_a: SGNSTAT:0000000
 188
 189 [Term]
 190 id: SGNSTAT:0000037
 191 name: Phenotypic BLUEs using LMER R
 192 is_a: SGNSTAT:0000000
 193
 194 [Term]
 195 id: SGNSTAT:0000038
 196 name: GEBVs using GBLUP from rrblup R package
 197 is_a: SGNSTAT:0000000
 198
 199 [Term]
 200 id: SGNSTAT:0000039
 201 name: Adjusted means from BLUPs using Sommer R
 202 is_a: SGNSTAT:0000000
 203
 204 [Term]
 205 id: SGNSTAT:0000040
 206 name: Phenotypic BLUPs using Sommer R
 207 is_a: SGNSTAT:0000000
 208
 209 [Term]
 210 id: SGNSTAT:0000041
 211 name: Adjusted means from BLUEs using Sommer R
 212 is_a: SGNSTAT:0000000
 213
 214 [Term]
 215 id: SGNSTAT:0000042
 216 name: Phenotypic BLUEs using Sommer R
 217 is_a: SGNSTAT:0000000