matrix_to_tree.sh: Allow for large number of samples
[autophylo.git] / README
blob9b0d2ab8e239d14aa193c60b58a3a12c95abc39c
1 This is a tool for automatic creation of phylogenetic tree
2 based on a set of genome files. It is made from a couple of
3 modular scripts that can be put together as needed. However,
4 to just let it do its thing, use the 'run.sh' script:
6         ./run.sh cmp_gencompress/cmp.sh tree-class-gencompress.png ex_class/*
8 It is possible to use different "comparators" - the actual
9 methods for comparing two DNA files, deciding whether they
10 are likely to be related:
12   * gencompress: TODO
14 Some example DNA sets:
16   * TODO